W skałach krasowiejących (głównie wapienie serii wierchowej) podczas czwartorzędu rozwinęły się systemy jaskiń. Po polskiej stronie odkryto dotychczas 800 jaskiń o łącznej długości 126,5 km[20]. Liczba poznanych jaskiń w części słowackiej jest mniejsza. Do największych jaskiń tatrzańskich należą:
- Cień Księżyca – najdłuższa w całych Tatrach (30 500 m, stan na październik 2012[21]) i najgłębsza (451 m) w Tatrach Wysokich,
- Jaskinia Wielka Śnieżna – najgłębsza (824 m deniwelacji), do stycznia 2010 uważana też za najdłuższą (23 619 m),
- Śnieżna Studnia – druga pod względem głębokości (763 m deniwelacji, 12 200 m długości),
- Jaskinia Wysoka za Siedmioma Progami – do lat 90. uważana za najdłuższą (11 660 m, 435 m deniwelacji),
- Jaskinia Bielska – najczęściej zwiedzana, najdłuższa (3829 m) w Tatrach Bielskich.
Niektóre jaskinie tatrzańskie są udostępnione dla turystów:
Jaskinia Wielka Śnieżna:
Jaskinia Mroźna: